半夜肚子疼拉肚子，首先应该考虑是饮食导致的，比如吃比较凉的食物或者不干净的食物从而出现肠道菌群的紊乱，或者是刺激到肠道引起炎症。出现这样的情况可以吃黄连素、思密达、肠道菌群等等药物；可以喝热水，注意腹部保暖，都可以有效地缓解腹痛以及拉肚子。如果拉肚子拉出来不仅有未消化的食物，还有脓血便或者排便次数非常频繁，伴有肛门的紧迫感或者肛门不适感，要引起注意，到院里面做相关检查。如果是细菌感染，则加用抗生素；如果是病毒感染可能要用抗病毒的药物。此外，在治疗期间最好吃清淡易消化的食物。