射精后腰痛最常见于慢性前列腺炎病人，慢性前列腺炎病人由于感染性致病微生物刺激膀胱颈部黏膜、前列腺部黏膜，会出现黏膜红肿、糜烂。致病微生物会沿膀胱逆行感染，引起双侧输尿管感染，进而引起肾盂感染。当射精后病人会出现致病微生物沿精液射到后尿道内，刺激后尿道黏膜，出现黏膜红肿糜烂，会出现射精后后尿道疼痛症状，同时病人会出现腰部不适、腰酸、腰痛症状，是由于肾盂有致病微生物感染后出现肾盂肾炎，出现腰部不适症状。病人出现上述症状时，需及时到泌尿外科规范的治疗。