慢性结肠炎指的是病变累及结肠黏膜和黏膜下层的慢性非特异性炎症，一般与免疫因素、环境因素与遗传因素有关。免疫异常是造成慢性结肠炎的主要原因，结肠炎患者肠黏膜分泌异常，黏液糖蛋白改变，影响肠黏膜的完整性，使一般不易通过正常肠黏膜，对正常人无害的肠道共生菌群、食物等抗原进入肠黏膜，激发一系列抗原特异性免疫反应与炎症变化。还有一些感染因素也会导致慢性结肠炎，遗传因素在结肠炎的发病过程中也起到很大的作用，临床上发现10%-15%的患者血缘亲属患有本病。