宫颈炎的药物治疗应针对病原体选择合理的抗生素，单纯急性淋病奈瑟菌感染常选用头孢菌类及头霉素类。沙眼衣原体感染所致的子宫颈炎药物选择四环素类，大环内酯类，喹诺酮类。若为淋病感染的子宫颈炎治疗选择抗淋病奈瑟菌外同时应选择抗衣原体感染的药物。若合并细菌性阴道病，通常选用甲硝唑及克林霉素。