小孩早上起床咳嗽的原因包括以下几方面：1.咽喉不适。由于在晨起时受到冷空气或者其他刺激性气味的刺激，而导致咽喉有不适的感觉会咳嗽，但是这种情况是偶发的。2.呼吸道疾病。由于咽喉炎或者感冒等上呼吸道感染，有可能会引发咽喉不适，其前期症状就会表现为咳嗽。3.交感神经兴奋。在晨起时和夜间入睡时，交感神经会格外兴奋，而交感神经兴奋有可能会刺激咳嗽的出现。4.心理作用。有些儿童由于对上学或者其他有压力的事情有逃避心理，因此有时会出现一些神经官能症表现。