肛门部位的尖锐湿疣，它的治疗实际上和生殖器部位的尖锐湿疣是一样的，一般可以通常采用激光治疗、电离子治疗，也可以采用冷冻的办法进行治疗。如果这些疣体比较大，那么也可以采用手术切除的办法进行治疗，特别是对于巨大型尖锐湿疣，一般首选进行手术切除。当然，有的尖锐湿疣在使用物理治疗的同时，还可以适当的配合使用免疫调节剂进行治疗，比如可以进行干扰素注射治疗、口服转移因子等，这样可以调节免疫，促进尖锐湿疣的恢复。另外，在尖锐湿疣治疗的同时，还需要注意局部的卫生，防止由于局部的卫生情况不理想而造成继发性的细菌感染。