临床上能够引起咳嗽两个月一直不好的原因有很多，主要考虑可能是呼吸系统相关疾病引起的症状。可能的呼吸系统相关疾病包括:慢性咽喉炎、慢性支气管炎急性发作、肺炎、肺气肿、支气管扩张、肺结核、肺脓肿和肺恶性肿瘤等。想要明确病因，需要进行相关检查，包括电子喉镜检查、胸部CT检查、结核菌素试验、血常规、降钙素原、血沉、肺肿瘤标志物检查等。根据检查结果，才可以明确病因，然后再给予对症治疗。