跑步后踝关节疼痛的原因有以下几个方面：1.跑步之前没有进行热身，或者在跑步时用力过猛，导致踝关节周围的肌肉、韧带拉伤，会出现明显疼痛。2.跑步的时间比较长，在跑步的过程中踝关节不断活动，关节之间的摩擦会比较多，会有炎性分泌物渗出引起无菌性的关节炎症，严重了还会出现积液，从而导致踝关节疼痛。3.踝关节之前本来就有外伤还没有完全恢复，跑步会增加对踝关节的刺激，很容易造成关节的二次损伤，进而引起疼痛。4.患有风湿性关节炎，跑步后容易导致急性发作而引起疼痛。