盐酸氨基葡萄糖胶囊不建议长期服用，任何药物都或多或少的带有一些副作用，盐酸氨基葡萄糖胶囊也不例外。当然盐酸氨基葡萄糖胶囊耐受性良好，仅偶尔会发生轻微的胃肠道不适，如恶心、胃灼热、腹泻等症状，出现胃肠道不良反应的患者，或者平时脾胃功能较弱的患者，可以饭后服用，以降低不良反应的发生率。有些病人可能会出现过敏反应，包括皮疹、瘙痒和皮肤红斑，对此药过敏者禁用。但长期或者过量服用会增加不良反应发生的频率和程度，给身体造成伤害，因此不建议长期服用。此药属于处方药，必须在医生的指导下合理使用。如正在服用其他药品，请就诊时告知医生。