在服用阿莫西林期间如果出现不良反应，要根据不良反应的轻重程度来确定是否需要立即停药。如果出现恶心、上腹饱胀不适等胃肠道的不适症状，如果症状比较轻，可以暂时不停药，给予相应的保护胃黏膜的治疗。但是如果出现了严重的腹泻、呕吐，甚至是假膜性肠炎等胃肠道反应，就要立即停药。另外，还有少数患者服用阿莫西林可能会出现皮疹、药物热甚至是胸闷、哮喘等过敏反应，此时要立刻停药，换用其他的抗感染药物来治疗，并且给予相应的抗过敏治疗。此外，还有少数患者可能会出现兴奋、失眠、焦虑等中枢神经系统症状，通常症状不严重不需要停药，在疗程结束之后停药之后这种症状可以自行缓解，而轻度的转氨酶的一过性升高通常也不影响治疗，在停药之后这种情况可以自行缓解。