咽口水的时候一侧喉咙痛，可能与下列的因素有关：1.患者患有急性的咽喉炎或扁桃体炎且尚处于病情的早期，此时病情仅仅累及到一侧的扁桃体或咽喉，就会出现在吞咽动作时，一侧的喉咙疼痛的现象。2.患者如果患上了腮腺炎等疾病，在疾病发作初期，由于腮腺部位的肿大，在患者做出吞咽或者咀嚼的动作时，也会引发肿大一侧部位的腮腺牵拉喉咙部位的肌肉，导致出现放射疼痛。3.咽喉的一侧如果出现了化脓或者是溃疡，在咽口水的时候也会有疼痛感。