针对宝宝的霉菌性肠炎，可以应用下面的处理措施来进行治疗：一、要及时进行对症支持治疗，因为患有霉菌性肠炎以后，就会引起大便次数增多，从而造成脱水以及电解质紊乱，这时可以及时口服补液盐来补充水分以及纠正电解质二、可以应用益生菌，因为霉菌性肠炎大多是由于肠道菌群紊乱继发的感染，可以应用小培菲康等益生菌来进行调治。另外还可以应用氟康唑来进行治疗，氟康唑是治疗霉菌的重要药物，可以起到抑制霉菌生长的作用。