女性的内膜异位囊肿，具体怎样的治疗，还需要根据囊肿体积的大小，内膜异位的部位，是否引起临床症状等决定的，如果子宫内膜异位到卵巢，引起卵巢巧克力囊肿，如果囊肿体积比较小，比如直径小于5厘米，没有引起任何的临床症状，这种情况可以暂时不治疗，定期做盆腔超声复查。如果女性有生育的要求，建议尽早的怀孕，如果没有生育的要求，也可以口服短效避孕药进行控制，延缓病情的发展。如果卵巢巧克力囊肿体积比较大，比如直径超过5厘米，引起下腹部疼痛，影响怀孕的情况下，就需要做手术，将卵巢巧克力囊肿切除进行治疗的。