当患眼分泌物比较多时，可以用无刺激性的冲洗液，比如3%的硼酸水，或者是生理盐水冲洗结膜囊。冲洗时要小心操作，避免损伤角膜上皮，冲洗液不要流入健眼，以免造成交叉传染。局部充分使用有效的抗生素滴眼液和眼膏，急性期阶段，每1-2小时1次。目前常使用的广谱氨基苷类和喹诺酮类药物，例如0.3%的妥布霉素、0.3%的氧氟沙星、0.3%-0.5%的左氧氟沙星滴眼液和眼药膏。流感嗜血杆菌感染而致的急性细菌性结膜炎或伴有咽炎、急性化脓性中耳炎的患者，除了局部用药，同时应该给予头孢类抗生素或者是利福平。严格注意个人卫生和集体卫生，提倡勤洗手、洗脸和不用手或衣袖擦拭眼睛，急性期的患者需要隔离，以免传播。