长期吃头孢菌素的副作用，首先与头孢菌素本身的副作用有关。头孢菌素本身有一定程度的肝功，肾功能损害。长期口服以后对肝肾功能的损害也会持续累积并加重，第二类副作用是由于。长时间服用头孢菌素不合理的抗生素使用会导致体内菌群失调，部分患者会出现腹泻等。而有一部分患者会导致继发真菌感染等表现，所以头孢菌素的使用往往需要有明确的指针的。才可以选择性的给予短期的抗感染治疗，但感染得到控制，以后一定要及时的调整药物或者停用抗生素。