男性在小便的时候出现尿道刺激性疼痛，主要是由于泌尿系感染、结石、结核以及尿道的肿瘤和异物等原因造成的，需要进行详细的检查及处理。如果存在泌尿系感染，患者往往会出现尿频、尿急、尿痛、尿道刺激感等临床症状。如果患者存在不洁性生活史，那么要高度警惕淋球菌感染的可能性。治疗上一方面要对症处理，另一方面要抗菌消炎治疗。如果患者存在泌尿系结石，有可能引起阴茎的疼痛向龟头放射，需要进行体格检查、彩超等明确诊断，必要的时候进行手术取出结石。