霉菌性肠炎不容易根治，特别容易复发，这种疾病需要正规、系统的按疗程用药治疗，才能够控制病情的发展。有霉菌性肠炎，可以吃治霉菌素片或者氟康唑、益康唑这类抗真菌的药物治疗，同时停止头孢菌素等抗生素的使用。在用药物治疗期间，还应该注意清淡饮食，不要吃辛辣、生冷、油腻、刺激性的瓜果，避免加重肠胃的负担，加重拉肚子的症状。在这期间，还应该注意提高身体的免疫力，体质强壮以后抗病能力强了，也能够减少疾病复发的几率。平时需要注意养成良好的生活习惯，不要熬夜过度，加强体育锻炼。