肛窦炎可以通过药物治疗和手术治疗。肛窦炎其实就是肛隐窝炎，主要由于粪便和炎症的反复刺激而引起，导致肛门出现隐痛排便时疼痛加重。急性期发作的肛窦炎需要用喹诺酮类的抗生素抗感染治疗，肛门内可以塞痔疮栓，并配合用清热祛湿活血化瘀的中药局部坐浴，也可配合中药灌肠治疗。能促进炎症的逐渐吸收，促进肛窦炎的痊愈。药物治疗效果不好，形成脓肿，肛乳头肥大。需进行手术治疗，把肛窦切开引流，手术后静脉点滴抗生素抗感染治疗。