各种类型的微生物都可能会引起男性尿道的感染，如真菌、细菌、支原体、衣原体、病毒等，其中最常见的是细菌的感染，最常见的临床症状是尿频、尿急、尿痛等，需要完善分泌物及尿培养检查才能确诊。不同类型的致病菌，所用的药物一般也不相同，微生物的耐药性，也会影响治疗的效果。如果是细菌引起的尿道感染，一般常用头孢类的药物或者喹诺酮类的药物，再根据药敏结果必要时做出调整，碱化尿液改善尿路刺激症状。如果是真菌感染引起的，需要抗真菌治疗。如果是支原体、衣原体感染引起的，最常用的是大环内酯类药物。病毒感染引起的，需要抗病毒治疗。