肛肠囊肿的治疗，一般以手术治疗为主，将囊肿组织完全切除，防止囊肿残留造成术后复发。继发感染者，可以通过抗感染、中药液或者高锰酸钾溶液薰洗坐浴，将感染控制后，再进行手术治疗。术后运用药物止疼，并保持肛周卫生干燥。肛肠囊肿多是发生在肛门，及其周围的囊性肿瘤性病变，会出现肛门红肿、肛门胀痛、肛门坠胀感等症状。平时清淡饮食，注意个人卫生。多吃蔬菜和水果，保持大便通畅柔软。不要用手挤压囊肿。