喉咙两侧疼痛可能是出现了咽喉炎、扁桃体炎，同时还有可能是急性会厌炎或扁桃体周围脓肿等各种疾病导致。出现这类疾病时会导致扁桃体肿大、黏膜充血，因此会出现比较明显的疼痛症状。需要及时去医院检查治疗。咽喉炎、扁桃体炎等各种疾病出现后需要判断是细菌还是病毒感染，若是细菌感染可以使用抗生素类的药物治疗。病毒感染可以选择使用抗病毒类的药物治疗。