头上长囊肿最有效的治疗手段是选择手术切除。对于比较小的病变，可以在局部麻醉下进行手术切除；病变比较大，可以通过静脉麻醉或者全身麻醉。由于头皮的供养血管非常丰富，在手术当中容易出现出血，操作过程当中应该注意止血，可以选择头皮夹止血，避免出血或者血肿的发生。术后切除的组织需要进行病理学检查，创面进行结节缝合，必要时需要留置引流条或者留置引流管。术后要注意预防感染，可以口服头孢氨苄片进行治疗，定期换药以及拆线。