男士生殖器上长了小水泡，最可能的原因是生殖器疱疹病毒感染所致。当感染以后可以出现在龟头、冠状沟、尿道口或阴茎皮肤、肛周、会阴区等皮肤，出现小水泡样的表现，可伴有溃疡、脓疱，也可表现为尿频、尿急、排尿疼痛等症状。部分患者可有疼痛、瘙痒、局部麻木等症状，大多都是通过不洁的性接触传播而导致，属于性病的一种，确诊需要留取疱液做病毒检测。如果检测出生殖器疱疹病毒，则可以确诊。治疗以抗病毒治疗为主，可以口服抗病毒药物，也可以局部涂抹抗病毒软膏进行治疗。