治疗上常规给予抗病毒药物治疗。对于轻型患者给予非甾体抗炎药物治疗，如阿司匹林、布洛芬、吲哚美辛等。中重度患者需给予糖皮质激素治疗，如泼尼松等，它能明显缓解甲状腺疼痛，少数患者治疗后可能会复发，复发后泼尼松治疗仍然有效。对甲状腺毒性表现，如心动过速等，可对症给予β受体阻滞剂治疗，如普萘洛尔、比索洛尔、倍他乐克等药物。针对一过性甲减者，可适当给予补充甲状腺素片替代治疗。亚甲状腺炎发病与病毒感染有关，如流感病毒，柯萨奇病毒，腺病毒和腮腺炎病毒等，起病前1到3周大多有这些病毒感染的症状，