慢性咽喉炎病因大致分为三类。第一个是局部因素，慢性咽喉炎多为急性咽炎反复发作或者延误治疗而转为慢性，另外有各种鼻炎，因鼻部阻塞而长期张口呼吸呼吸以及鼻腔分泌物下流导致长期刺激咽部，或慢性扁桃体炎都可以影响导致出现慢性咽喉炎。另外一种就是物理化学因素的刺激，比如粉尘，颈部放疗，长期接触化学气体，过度抽烟喝酒等等。另外就是全身因素，比如各种慢性病，贫血，便秘，下呼吸道慢性的炎症，心血管疾病，代谢障碍，肝病以及肾病都可以出现继发性慢性咽喉炎。