马蹄内翻足的确切原因目前还并不是十分明确，但是一般考虑和以下因素有关。第一个就是遗传因素，马蹄内翻足是具有一定遗传倾向的，在特定地区特定家族内会出现马蹄内翻足聚集发作的情况。第二个就是胎儿在宫内发育异常产生的，比如基因突变或者是发育受阻以及母体产生疾病或者是药物、吸烟喝酒等原因，造成胎儿的发育异常导致的。第三个原因是由于损伤导致的，比如在生产时造成的产伤，还有在后天产生的肌肉神经损伤，会出现足部的肌肉力量不平衡，运动功能障碍导致马蹄内翻足。再有一个原因就是继发于其他疾病导致的，比如脊髓灰质炎、神经疾病、肌肉疾病等等情况。