男的小便时候尿道刺痛主要考虑为鳞病以及尿道结石等原因导致。如果有淋病，就会导致尿道口出现脓性分泌物，颜色为白色或者是黄色，同时在小便的时候出现尿道刺痛的症状。这种情况就需要使用抗生素药物来进行治疗，比如阿奇霉素。除了淋病以外，如果有尿道结石，当小便的时候由于尿液的冲击力就会导致结石刮伤尿道的粘膜，从而引起尿道刺痛。需要及时到医院进行就诊治疗，才能够缓解小便时候尿道刺痛的症状。