跖疣根治的方法主要有以下几种：1、物理治疗：物理治疗主要包括激光治疗、冷冻治疗等，通过这些方法可以将表面疣体去除达到治疗的目的。2、药物治疗：药物治疗包括：外用药物和内服药物两种，在医生的指导下外用抗病毒类的药膏，减轻局部反应，同时口服增强免疫力的药物，避免病毒再次复发。3、浅层X光线治疗：该种方法是治疗跖疣最新的一种方法，具有见效快、恢复期短的特点，但是费用较高。跖疣发病早期是治疗的最佳时期，这时病情较轻，进行系统性治疗，可促使病情在短期内恢复。