儿童支原体衣原体可通过咽部式子或者静脉血液来进行检查。取咽拭子标本做快速的支原体、衣原体培养，如果培养结果阳性提示感染。检查抗体，通常有2种方法，如可以做支原体、衣原体、IgM、IgG抗体检查，如果IgM阳性可以提示支原体、衣原体症状感染。另外也可以抽血做支原体、衣原体的总抗体检查，如果总抗体滴度大于1:160以上，结合临床症状可以考虑感染。取咽拭子标本做支原体、衣原体、DNA检测，如果检测结果的拷贝数比较高，也可以诊断为支原体、衣原体感染。