目前三叉神经痛的病因尚不完全清楚。考虑可能由于血管压迫，三叉神经根是三叉神经痛最主要的原因。这种血管压迫可能是被动脉袢或血管畸形压迫扭曲或者牵拉。还有一些继发性的三叉神经痛，如脑后窝的肿瘤，脑膜瘤、听神经瘤表皮样囊肿，当压迫三叉神经根的时候，也可以引起三叉神经痛。老年人脑萎缩是三叉神经受牵拉，还有拔牙后的三叉神经末梢形成神经瘤等，也可以引起三叉神经痛。脑干的肿瘤、多发性硬化，还有延髓空洞症状也可以引起症状性的三叉神经痛，引起引起三叉神经痛的病因有很多。