孕期卵巢囊肿包括两种原因：第一种是生理性囊肿，这种情况通常无需特殊处理，定期复查即可，一般三个月左右可自行消失；第二种是病理性囊肿，常见的病因有囊腺瘤、子宫内膜异位囊肿，需根据具体情况来进行治疗。当囊肿体积较大时，超过了五公分，则考虑癌变的可能性较高，此时需要做组织切片活检确定囊肿的性质。如果在多次检查中发现囊肿体积增长速度过快，必要时行手术切除。