十二指肠的药物治疗主要包括：1，抑制胃酸治疗，主要有两种药物，H2受体拮抗剂和质子泵抑制剂，质子泵抑制剂有较强的抑制胃酸分泌的作用，是治疗溃疡的首选药物，常见的药物包括奥美拉唑，艾司奥美拉唑等，推荐疗程4~6周，服用4周PPI及质子泵抑制剂，十二指肠溃疡的愈合率可达90%~100%。2，胃黏膜保护治疗，可中和胃酸或直接覆盖溃疡面，以阻断胃酸的消化，包括铝碳酸镁、硫糖铝等。3，幽门螺旋杆菌感染的治疗，幽门螺旋杆菌即HP阳性患者需行根除HP及抗溃疡治疗，初次治疗予以质子泵抑制剂加铋剂加两种抗菌药物的四联疗法，疗程为10~14天，有效根治率达90%。4，非甾体类抗炎药物相关溃疡的治疗，首先要停服NSAIDs即非甾体类抗炎药，采用抗溃疡药物治疗。