阴茎根部长有肉疙瘩，最大的可能性是阴茎根部的毛囊发炎，跟不注意个人卫生导致局部瘙痒，患者自己抓挠之后就会出现毛囊发炎，出现硬疙瘩。这时候还会伴有明显的红肿、压痛现象，需要使用抗生素进行治疗，可以涂抹红霉素软膏或百多邦软膏。如果肉疙瘩是无痛性的，而且呈菜花样或者鸡冠状，以及有不洁性生活史的男性，这时候考虑尖锐湿疣的可能性很大。尖锐湿疣是由人乳头状病毒感染引起，主要通过性传播或接触公用的设施引起的传播。这种肉疙瘩也要考虑是寻常疣或皮肤癌的早期表现，要保持局部的清洁干燥，不能用手去抠以免破损导致感染，引起更严重的后果，要及时的到医院就诊，让医生检查确诊再对症治疗。