引起肝囊肿疾病的原因主要有以下几点:第一，肝囊肿的首要病因是先天性的，天性的肝囊肿和遗传因素是息息相关的，比如说肝内小胆管的一些炎症，可能局部受到刺激造成局部增生，液体的潴留所造成的一些囊泡，我们称之为肝囊肿。第二，各种感染造成的。在日常生活中可能会受到病菌的感染造成内分泌紊乱从而产生肝囊肿，身体在受到病菌的感染以后，使囊肿内部的因素活性增强，进一步造成肝囊肿增大的情况。第三，对于寄生虫感染引起的。一些寄生虫，比如说在牧区，像内蒙、新疆等这些地区，肝包虫病会造成肝囊肿的发生。