阴茎轻微刺痛考虑是以下几种因素导致的：1、阴茎炎。当阴茎发炎的时候会产生大量的细菌，刺激到阴茎内部和外部，导致阴茎会出现轻微的疼痛，还伴随红肿、瘙痒等现象。2、外伤。可能是在玩耍的过程中，不小心磕到碰到了阴茎的局部，出现暂时性的刺痛。3、前列腺炎。当前列腺发炎之后会产生大量的致病菌，刺激到前列腺内部，产生大量的前列腺液，前列腺液中会带有少量的病菌，排出体外的时候会污染到阴茎局部和周围。检查如果是阴茎炎症，可以选择药物红霉素、左氧氟沙星或者是阿奇霉素治疗；如果是前列腺炎可以选择盐酸左氧氟沙星或者红霉素治疗，要注意隐私部位的清洗。