大部分三叉神经痛病人可以用药物治疗控制，相当一部分病人需长期服药，不能根除，也不能完全控制头痛发作，还有一些病人不能忍受药物的副作用而终止治疗。大约20%病人药物治疗无效，可以用药局部注射封闭，但是疗效也只能维持半年左右。经皮肤进行射频神经根切断术，有较好的疗效，约有30%在手术后仍复发。对少数顽固性的三叉神经痛，在各种治疗均告失败后，可以进行外科开颅手术，将三叉神经根切断，以求永久疗效，但是也会出现并发症。