阴茎有点疼痛可由很多情况引起，多见于炎症、阴茎硬结、性交过度等，要具体情况具体分析。建议患者及时去医院泌尿科就诊，进行尿常规、尿培养、泌尿生殖系统B超检查，先检查一下有没有局部问题，有无尿道炎的情况。这也可能由其他部位投射引起的，比如前列腺炎和间质性膀胱炎。需及时完善检查，明确病因。如果是由泌尿系感染引起的，需要在医生指导下选用敏感的抗生素抗感染治疗；同时需多喝水、勤排尿、忌饮酒及辛辣刺激食物。