患者患有慢性尿道感染，应该根据检查结果来选择敏感的药物来治疗。如果是普通细菌感染或者是淋球菌感染，往往可以选择青霉素类抗生素、喹诺酮类抗生素、头孢类抗生素等药物来进行治疗。如果是衣原体、支原体所引起的慢性尿道感染，可以采用阿奇霉素、罗红霉素以及多西环素等药物来进行治疗。如果是滴虫所引起的慢性尿道感染，往往可以采用抗滴虫药物来治疗，比如采用甲硝唑、替硝唑等药物来进行治疗。如果是念珠菌、霉菌、真菌所引起的慢性尿道感染，往往会采用伊曲康唑、酮康唑、氟康唑等药物进行治疗。在治疗的同时，患者平时需要注意多饮水，勤排尿，避免食用辛辣刺激性食物，也可以辅助中成药来进行同时治疗，比如清热通淋、热淋清等药物进行治疗。