肾囊肿和肾结石是两种不同的疾病，两种虽然病情不同，但是两者是可以同时发生在患者身上，肾囊肿之内也有可能形成钙化、结石。处理的措施包括以下几个方面：第一，到正规医院进行详细的检查，包括彩超，CT等等来综合性的判断病情。第二，如果患者存在临床症状，建议进行对症处理。第三，根据囊肿以及结石的具体情况，制定详细的治疗方案。体积比较小的囊肿，可以观察等待。体积比较大的囊肿可以进行外科干预治疗。体积比较小的肾结石，可以采用自行排石或者药物辅助排石。体积比较大的结石，可以进行体外冲击波碎石或者手术。以上方案仅供参考，具体药品使用请结合自身情况在专业医生指导下用药。