角膜炎的病因很多，有感染因素，主要病原微生物有细菌、真菌、病毒，近年来有关棘阿米巴角膜炎的报道也不断增加。其他的还有衣原体、结核杆菌，梅毒螺旋体等等。因此，首先要明确病因，再根据病因选择敏感的药物治疗。角膜炎也有内源性的因素，一些自身免疫性疾病如类风湿性关节炎，可出现角膜病变；某些全身病也可以波及角膜，如维生素A缺乏引起的角膜干燥或角膜软化。同样也需要明确病因，治疗病因再结合眼部局部的营养角膜，完善眼表功能等治疗。还有局部蔓延也会引起角膜炎，比如邻近的组织炎症，可波及角膜，如结膜炎，巩膜炎，虹膜睫状体炎。因此也要先治疗原发病，控制完之后有需要再结合角膜炎的治疗。