直肠充血、水肿应该采取下列处理措施：首先，应该明确具体病因，例如肠炎、肠结核、肠道肿瘤等。结合患者病情，采取抗炎、抗结核药物治疗，稳定局部病情。同时对于肿瘤病变，需要积极手术，再辅助放化疗等治疗措施，从而稳定病情。其次，在上述治疗过程中，还需要采取一般治疗。需要患者调整饮食结构，吃一些易消化、易吸收、富含营养的食物，不要抽烟、饮酒，更不能吃一些辛辣刺激性食物，减轻对肠壁的刺激，从而改善局部症状。