十二指肠球溃疡的治疗主要是运用抑酸药，目前常用的药就是质子泵抑制剂，能强烈的抑制胃酸的分泌，从而减少这种攻击因子对胃黏膜的损伤，促进胃黏膜的愈合。质子泵抑制剂目前主要包括的药物就是奥美拉唑、艾司奥美拉唑、雷贝拉唑以及兰索拉唑等，如果单纯的用质子泵抑制剂，可以促进球溃疡的愈合，但是更多的要寻找球溃疡的原因，比如十二指肠球溃疡是由于感染了幽门螺杆菌所引起，所以治疗十二指肠球溃疡还要根除幽门螺杆菌。目前根除幽门螺杆菌的方法是四联疗法，两种抗生素加一种质子泵抑制剂，再加一种铋剂。如果十二指肠球溃疡是药物引起的，比如服用阿司匹林和止疼片所引起，最好停止这些药物。如果不能停止，可能需要用质子泵抑制剂联合运用，来预防十二指肠球溃疡的复发。