白塞氏病的病因尚未完全清楚，可能跟感染、自身免疫等因素有关。有学者发现白塞氏病溃疡的渗出物涂片中有包涵体，所以提出病毒感染可能跟白塞病的发病有关。还有的学者从患者的分泌物中提取出链球菌，提示白血病的发病与链球菌的感染可能有关。此外，有些学者主张白塞病与自身免疫有一定的关系。有的患者体内出现了抗口腔黏膜的自身抗体，而血清的球蛋白增高、血清的补体C3升高，均提示可能跟自身免疫有关，是一种自身免疫性的疾病。还有的学者认为患者白塞病的发生跟患者血液中的纤维蛋白溶解活性缺陷有关。还有的学者认为白血病的发生与患者的情绪紊乱、过度劳累、内分泌因素等有关。