男性感染霉菌的治疗办法主要是使用抗霉菌药物。霉菌是一种特殊的微生物，因此男性在感染霉菌之后，应该针对性的选择对霉菌有抑制和杀灭的抗生素来使用。具体根据感染霉菌所导致的疾病，可以采取外用软膏或者口服药物联合的方法来进行治疗。由于霉菌本身治疗难度比较大，因此用药时间要比较长，在用药过程中要注意加强锻炼，提高自身的免疫力，用药结束之后要进行复查。