肛窦炎的治疗方法主要就是包括手术治疗以及非手术的药物保守治疗。手术治疗主要是针对肛窦炎较为严重，甚至是导致了肛管直肠周围脓肿的形成，或者是肛窦炎通过规范系统的药物保守治疗，效果不理想，仍然反复的发生临床症状的，也可以通过手术进行治疗。肛窦炎在诊断明确以后，早期是以药物治疗为主，可以口服广谱的抗生素药物，还可以使用中药成分的制剂进行保留灌肠，另外也可以使用甲硝唑溶液进行保留观赏，都可以起到良好的治疗效果。如果有发生疼痛的，要合理使用止疼的药物，在进行对症治疗的同时，也一定要注意多休息，避免劳累，避免熬夜，保持规律的作息时间。