如果肛门长了肉疙瘩且有明显的疼痛，具体的治疗方式要找到相应的原因后对症治疗。如果这个肉疙瘩是痔疮引起的，伴有疼痛，考虑外痔或者血栓性外痔，合并感染的情况多见，建议采取保守治疗的方式，比如高锰酸钾稀释液局部熏洗、坐浴。痔疮引起的肉疙瘩还要在患处局部涂抹痔疮膏或者选择一些栓剂肛塞治疗，一定要避免辛辣、刺激饮食。如果肛门长了肉疙瘩是由于肿瘤引起的，比如直肠癌，建议完善检查明确分期，如果是早期的，采取手术治疗的方式。如果是中晚期的，一般采取化疗、靶向治疗、免疫治疗等。