溃疡性结肠炎目前病因不明，可能与感染因素、精神因素、遗传因素、免疫因素及酶的因素和保护性物质缺乏有关。近年来由于免疫学和遗传学的研究进展，目前认为免疫因素遗传因素是主要因素，感染因素和精神因素等多种因素，只是诱发和继发因素。