小便酸痛有可能是泌尿系统感染、结石、肿瘤等原因导致的。1、泌尿系统感染性疾病，比如尿道炎、膀胱炎、急性肾盂肾炎等，以急性细菌性膀胱炎为例，患者还会出现排尿次数增多、尿急、血尿等症状，患者还会自觉排尿结束后有尿不尽感。2、尿路结石：以膀胱结石为例，典型的症状为排尿中断，疼痛会向远端尿道以及阴茎头部放射，患者会自觉排尿费力甚至排尿困难；当合并感染时，小便时的酸痛症状会更加严重。3、泌尿系统的肿瘤：以膀胱肿瘤为例，往往以血尿为首发症状，患者还会出现排尿时的酸痛以及尿急、尿频等症状。