龟头上有个小水泡，可能的原因主要包括：一，摩擦刺激导致龟头上起了小水泡，主要是由于穿的内裤过紧，或者是患者有包皮过长的问题，包皮内有包皮垢残留，包皮垢被包皮龟头产生摩擦刺激，而导致龟头部位起了小的水泡。二，药物过敏引起的龟头部位起水疱。三，感染了单纯疱疹病毒Ⅱ型以后，引起龟头部位出现小的疱疹，这种症状属于一种性传播疾病，一般都是在发生了不洁性行为之后一段时间出现起泡疹的现象，具体的原因还需要到医院进行检查后才能够确定。