检查出衣原体阳性表明出现了衣原体的感染。不同的衣原体通常感染的部位组织是不同的，所以引发衣原体感染的原因也是不同的。如肺炎衣原体的传播主要通过呼吸道飞沫传播，而沙眼衣原体的传播通常主要通过眼手传播。目前针对衣原体的感染，主要是通过药物治疗，常用的药物有大环内酯类、四环素类等药物，效果都是非常显著的，但是药物需在医生指导下使用。